在高空中，空气中氧气成分相对减少、气压降低，而孕妇在怀孕期间人体的免疫系统处于相对较弱状态，抗外界干扰能力差，乘坐飞机时由于起飞和降落时有巨大的惯性，外加因海拔高度急剧变化引起的大气压强差，更容易引起人体不适。
医学认为，早孕期间（1个月至3个月）胎盘没有完全发育成熟，相对容易流产，而航空旅行时飞机起降重力变化、气压、气流颠簸、晕动症等都有可能使得流产几率增加。机场安检时的X线照射、高空较地面强10倍以上的宇宙辐射，以及核事故所泄露的空中辐射悬浮物，都有可能影响早期胚胎而造成胎儿畸形。
妊娠7个月以后则容易发生早产、胎盘早剥、高血压、静脉炎，以及不慎摔倒或碰撞，这些都会增加母体或胎儿发生意外的几率。因此，早孕期间和妊娠7个月以上不宜乘坐飞机。
航空公司对孕妇搭乘飞机的限制或规定，既是出于对孕妇及胎儿安全的考虑（孕妇在飞行和旅行途中容易发生早产、流产、胎儿宫内缺氧等意外事故，而飞机上缺乏相应的医疗设备，一旦出现意外情况，后果不堪设想），也是为了维护其他旅客以及航空公司的利益。孕妇乘坐飞机，若在飞行过程中发生出血、临产等情况，出于安全考虑，飞机必须备降至最近的机场送去医疗，这就会造成当次航班的延误，甚至影响到后续一系列的航班，影响到众多旅客的出行，同时也会给航空公司造成巨大的经济损失。
孕妇搭乘飞机的限制或规定
国内航空公司对孕妇乘机制定了一些运输规定，《中国民用航空旅客、行李国际运输规则》规定孕妇乘机，应当经承运人同意，并事先作出安排。只有符合运输规定的孕妇，航空公司方可接受其乘机。具体规定大致如下：
（1）怀孕不足8个月（32周）的健康孕妇，可以按一般旅客运输。需要带好围产期证明，证明自己孕期在32周以内。不少准妈妈原本可以乘机，但因为没有围产期证明，工作人员无法判断孕期，也只能被拒载。
（2）怀孕不足8个月、医生诊断不适宜乘机者，航空公司一般不予接受。
（3）怀孕超过8个月不足9个月（36周）的健康孕妇乘机，应提供包括下列内容的医生《诊断证明书》。具体内容是，旅客姓名、年龄、怀孕时期（如果已超过36周以上的孕妇是短途旅行，还要注明预产期）、预产期、航程和日期、是否适宜乘机、在机上是否需要提供其他特殊照料等。《诊断证明书》应在旅客乘机前72小时内填开（一式二份），并经县级（含）以上的医院盖章和该院医生签字方能生效。否则承运人有权不予承运。
（4）怀孕超过9个月（36周），预产期在4周以内，或预产期不确定但已知为多胎分娩或预计有分娩并发症者，航空公司不予接受运输。
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